國際關系學科專業點2002年設立于原亞洲太平洋研究所，2012年亞洲太平洋研究所、歐亞研究所與上海市國際問題研究中心合并為國際關系研究所，該專業點現為國際關系研究所主要學科。本學科主要研究領域為國際關系理論、大國關系與戰略、地區國際關系（東亞、中亞、南亞、歐洲、中東、非洲、拉美等）、全球治理、國際體系改革、海洋安全、國際政治經濟學等。本學科點的學術梯隊由資深博士生導師、年富力強的碩士生導師與中青年科研人員組成。
目前這個學科擁有國家、上海市、各級部委辦和海外委托各種課題；出版《國際關系研究》雙月刊雜志；與世界經濟研究所共同出版年度性的《國際地位報告》。與海內外著名智庫有廣泛的交流與學術合作。
經過10多年的不斷地發展壯大，本學科已經出版了一系列的重要成果和形成了多個獨具特色的研究領域，在國內外產生了重要的影響力。這些領域包括：
大國關系與戰略研究：在中美、中日、中俄、中歐、中非關系、中國國家安全戰略、美國東亞與中亞戰略、俄羅斯安全戰略研究方面，已經發表了一些對我國外交政策、學科建設有重要影響的專著、研究報告和論文。
海洋沖突與合作研究：重點是大國的海洋戰略、東海與南海領土爭端、海洋爭議解決與危機管理、海上通道安全與海洋開發合作模式。目前已經形成4-5人的研究梯隊，擁有國家、地方和部門多項課題，在政策咨詢方面發揮著越來越大的作用。
地區沖突與合作研究：重點是中亞、東南亞、中東的民族、宗教、領土、邊界、恐怖主義及伊斯蘭極端勢力等非傳統安全及合作問題研究。有關專家已經在國內外一流學術期刊上發表大量學術性論文，其研究水平得到同行的高度認可；同時研究團隊撰寫的一些研究報告，獲得了中央領導的重視。
地區組織研究：研究所所設的亞太經濟合作組織（APEC）中心曾為2001年上海APEC領導人峰會作出了貢獻。作為國內主要的中心之一，也是上海政府資助成立的專門研究機構，它已經同國際APEC聯席會議和APEC秘書處建立了固定關系。上海合作組織研究中心是國家的主要研究基地，為上海合作組織峰會和各種合作項目提供了眾多的政策咨詢，為國家推動與俄羅斯和中亞國家的合作作出了卓越的貢獻。
國際體系與理論研究：重點研究國際關系理論、全球治理理論、中國外交理論、國際機制和國家主權等問題，及中美在東亞地區的利益與競爭；兩岸關系中的美國因素、中日關系、美日同盟作用等。
跨國界問題治理研究：重點研究包括：地區內的移民和難民、全球公地、環境、能源、流行病與氣候問題合作等。其中，我所與國務院僑辦、上海市僑聯、統戰部有課題合作，有關專著（《國家關系中的華僑華人和華族》）和論文曾獲得上海社會科學一等、二等獎。
